Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC1P35052 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC1P35052 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC1P35052 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPC1P35052 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPC1P35052 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC1P35052 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC1P35052 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC1P35052 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC1P35052 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC1P35052 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC1P35052 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC1P35052 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC1P35052 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC1P35052 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC1P35052 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPC1P35052 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPC1P35052 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC1P35052 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC1P35052 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC1P35052 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC1P35052 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC1P35052 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC1P35052 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC1P35052 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC1P35052 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC1P35052 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC1P35052 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC1P35052 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC1P35052 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC1P35052 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC1P35052 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC1P35052 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC1P35052 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC1P35052 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC1P35052 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC1P35052 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC1P35052 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC1P35052 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC1P35052 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC1P35052 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC1P35052 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC1P35052 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC1P35052 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC1P35052 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC1P35052 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC1P35052 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC1P35052 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC1P35052 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC1P35052 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC1P35052 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC1P35052 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC1P35052 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC1P35052 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC1P35052 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC1P35052 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC1P35052 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC1P35052 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC1P35052 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC1P35052 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC1P35052 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC1P35052 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC1P35052 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC1P35052 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC1P35052 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC1P35052 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC1P35052 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC1P35052 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC1P35052 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC1P35052 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC1P35052 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC1P35052 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC1P35052 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC1P35052 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC1P35052 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC1P35052 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC1P35052 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC1P35052 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC1P35052 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC1P35052 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC1P35052 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC1P35052 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC1P35052 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC1P35052 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC1P35052 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC1P35052 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC1P35052 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC1P35052 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC1P35052 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC1P35052 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC1P35052 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC1P35052 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC1P35052 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC1P35052 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC1P35052 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC1P35052 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC1P35052 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC1P35052 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC1P35052 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC1P35052 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms