Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRABP1P29762 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRABP1P29762 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP1P29762 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms