Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD1CP29017 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD1CP29017 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD1CP29017 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD1CP29017 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD1CP29017 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD1CP29017 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD1CP29017 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD1CP29017 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD1CP29017 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CD1CP29017 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD1CP29017 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD1CP29017 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD1CP29017 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD1CP29017 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD1CP29017 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD1CP29017 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD1CP29017 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD1CP29017 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD1CP29017 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD1CP29017 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD1CP29017 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD1CP29017 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD1CP29017 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD1CP29017 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD1CP29017 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD1CP29017 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD1CP29017 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD1CP29017 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD1CP29017 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD1CP29017 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD1CP29017 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD1CP29017 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD1CP29017 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD1CP29017 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD1CP29017 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD1CP29017 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD1CP29017 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD1CP29017 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CD1CP29017 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD1CP29017 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD1CP29017 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CD1CP29017 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD1CP29017 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD1CP29017 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD1CP29017 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CD1CP29017 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD1CP29017 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD1CP29017 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD1CP29017 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD1CP29017 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CD1CP29017 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD1CP29017 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD1CP29017 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD1CP29017 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD1CP29017 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD1CP29017 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD1CP29017 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD1CP29017 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD1CP29017 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD1CP29017 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD1CP29017 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD1CP29017 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD1CP29017 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD1CP29017 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD1CP29017 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD1CP29017 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CD1CP29017 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD1CP29017 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD1CP29017 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD1CP29017 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD1CP29017 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD1CP29017 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CD1CP29017 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD1CP29017 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD1CP29017 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD1CP29017 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD1CP29017 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD1CP29017 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD1CP29017 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD1CP29017 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD1CP29017 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD1CP29017 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD1CP29017 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD1CP29017 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CD1CP29017 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD1CP29017 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD1CP29017 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD1CP29017 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD1CP29017 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD1CP29017 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD1CP29017 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD1CP29017 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD1CP29017 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD1CP29017 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD1CP29017 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD1CP29017 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD1CP29017 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD1CP29017 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD1CP29017 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms