Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PTPRMP28827 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PTPRMP28827 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRMP28827 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRMP28827 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRMP28827 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRMP28827 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRMP28827 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRMP28827 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
PTPRMP28827 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
PTPRMP28827 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
PTPRMP28827 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTPRMP28827 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRMP28827 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRMP28827 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRMP28827 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PTPRMP28827 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PTPRMP28827 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PTPRMP28827 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PTPRMP28827 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PTPRMP28827 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
PTPRMP28827 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PTPRMP28827 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PTPRMP28827 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PTPRMP28827 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PTPRMP28827 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
PTPRMP28827 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRMP28827 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PTPRMP28827 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
PTPRMP28827 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRMP28827 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PTPRMP28827 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PTPRMP28827 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PTPRMP28827 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTPRMP28827 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTPRMP28827 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRMP28827 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRMP28827 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRMP28827 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms