Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO1P25800 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO1P25800 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO1P25800 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO1P25800 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO1P25800 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMO1P25800 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMO1P25800 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO1P25800 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO1P25800 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO1P25800 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO1P25800 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO1P25800 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO1P25800 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO1P25800 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO1P25800 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO1P25800 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO1P25800 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO1P25800 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO1P25800 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO1P25800 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO1P25800 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO1P25800 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO1P25800 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO1P25800 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO1P25800 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO1P25800 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO1P25800 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO1P25800 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO1P25800 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO1P25800 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO1P25800 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO1P25800 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO1P25800 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO1P25800 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO1P25800 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO1P25800 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO1P25800 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO1P25800 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO1P25800 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO1P25800 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO1P25800 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO1P25800 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO1P25800 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO1P25800 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO1P25800 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO1P25800 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO1P25800 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO1P25800 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO1P25800 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO1P25800 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO1P25800 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO1P25800 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO1P25800 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO1P25800 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO1P25800 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO1P25800 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMO1P25800 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO1P25800 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO1P25800 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO1P25800 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO1P25800 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO1P25800 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO1P25800 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO1P25800 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO1P25800 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO1P25800 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO1P25800 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO1P25800 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO1P25800 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO1P25800 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO1P25800 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO1P25800 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO1P25800 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO1P25800 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO1P25800 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO1P25800 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO1P25800 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO1P25800 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO1P25800 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO1P25800 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO1P25800 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO1P25800 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO1P25800 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO1P25800 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO1P25800 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO1P25800 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO1P25800 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO1P25800 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO1P25800 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO1P25800 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO1P25800 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO1P25800 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMO1P25800 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO1P25800 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO1P25800 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO1P25800 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO1P25800 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO1P25800 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO1P25800 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms