Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSSP25774 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSSP25774 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSSP25774 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTSSP25774 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTSSP25774 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSSP25774 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSSP25774 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSSP25774 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSSP25774 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSSP25774 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSSP25774 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSSP25774 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSSP25774 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSSP25774 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSSP25774 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSSP25774 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSSP25774 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSSP25774 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSSP25774 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSSP25774 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSSP25774 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSSP25774 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSSP25774 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSSP25774 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSSP25774 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSSP25774 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSSP25774 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSSP25774 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSSP25774 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSSP25774 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSSP25774 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSSP25774 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSSP25774 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSSP25774 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSSP25774 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSSP25774 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSSP25774 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSSP25774 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSSP25774 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSSP25774 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSSP25774 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSSP25774 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSSP25774 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSSP25774 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSSP25774 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSSP25774 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSSP25774 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSSP25774 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSSP25774 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSSP25774 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSSP25774 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSSP25774 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSSP25774 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSSP25774 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSSP25774 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSSP25774 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSSP25774 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSSP25774 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSSP25774 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSSP25774 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSSP25774 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSSP25774 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSSP25774 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSSP25774 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSSP25774 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSSP25774 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSSP25774 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSSP25774 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSSP25774 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSSP25774 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSSP25774 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSSP25774 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSSP25774 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSSP25774 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSSP25774 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSSP25774 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSSP25774 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSSP25774 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSSP25774 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSSP25774 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSSP25774 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSSP25774 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSSP25774 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSSP25774 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSSP25774 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSSP25774 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSSP25774 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms