Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTAFRP25105 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTAFRP25105 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTAFRP25105 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms