Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKACBP22694 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACBP22694 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACBP22694 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms