Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTNP21246 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTNP21246 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTNP21246 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTNP21246 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTNP21246 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTNP21246 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTNP21246 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTNP21246 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTNP21246 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTNP21246 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTNP21246 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTNP21246 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTNP21246 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTNP21246 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTNP21246 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTNP21246 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTNP21246 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTNP21246 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTNP21246 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTNP21246 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTNP21246 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTNP21246 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTNP21246 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTNP21246 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTNP21246 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTNP21246 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTNP21246 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTNP21246 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTNP21246 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTNP21246 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTNP21246 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTNP21246 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTNP21246 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTNP21246 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTNP21246 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTNP21246 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTNP21246 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTNP21246 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTNP21246 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTNP21246 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTNP21246 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTNP21246 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTNP21246 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTNP21246 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTNP21246 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTNP21246 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTNP21246 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTNP21246 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTNP21246 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTNP21246 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTNP21246 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTNP21246 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTNP21246 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTNP21246 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTNP21246 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTNP21246 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTNP21246 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTNP21246 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTNP21246 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTNP21246 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTNP21246 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTNP21246 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTNP21246 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTNP21246 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTNP21246 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTNP21246 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTNP21246 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTNP21246 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTNP21246 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTNP21246 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTNP21246 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTNP21246 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTNP21246 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTNP21246 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTNP21246 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTNP21246 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTNP21246 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTNP21246 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTNP21246 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTNP21246 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTNP21246 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTNP21246 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTNP21246 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTNP21246 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTNP21246 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTNP21246 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTNP21246 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTNP21246 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTNP21246 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTNP21246 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTNP21246 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTNP21246 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTNP21246 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTNP21246 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTNP21246 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTNP21246 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTNP21246 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTNP21246 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTNP21246 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms