Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTF3P20783 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTF3P20783 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTF3P20783 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTF3P20783 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NTF3P20783 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTF3P20783 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTF3P20783 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTF3P20783 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTF3P20783 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTF3P20783 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTF3P20783 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTF3P20783 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTF3P20783 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTF3P20783 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTF3P20783 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTF3P20783 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTF3P20783 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTF3P20783 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTF3P20783 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTF3P20783 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTF3P20783 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTF3P20783 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTF3P20783 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTF3P20783 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTF3P20783 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NTF3P20783 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NTF3P20783 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NTF3P20783 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NTF3P20783 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NTF3P20783 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NTF3P20783 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NTF3P20783 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NTF3P20783 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NTF3P20783 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NTF3P20783 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NTF3P20783 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NTF3P20783 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NTF3P20783 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NTF3P20783 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NTF3P20783 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NTF3P20783 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NTF3P20783 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NTF3P20783 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NTF3P20783 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NTF3P20783 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NTF3P20783 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NTF3P20783 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NTF3P20783 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NTF3P20783 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NTF3P20783 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NTF3P20783 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NTF3P20783 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NTF3P20783 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NTF3P20783 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NTF3P20783 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NTF3P20783 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NTF3P20783 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NTF3P20783 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NTF3P20783 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NTF3P20783 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NTF3P20783 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTF3P20783 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTF3P20783 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTF3P20783 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTF3P20783 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTF3P20783 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF3P20783 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF3P20783 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF3P20783 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF3P20783 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF3P20783 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF3P20783 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF3P20783 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTF3P20783 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF3P20783 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF3P20783 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF3P20783 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF3P20783 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF3P20783 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF3P20783 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF3P20783 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF3P20783 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF3P20783 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF3P20783 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF3P20783 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF3P20783 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF3P20783 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF3P20783 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF3P20783 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF3P20783 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF3P20783 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF3P20783 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF3P20783 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF3P20783 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF3P20783 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF3P20783 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF3P20783 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF3P20783 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF3P20783 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms