Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL3P20749 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL3P20749 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BCL3P20749 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCL3P20749 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCL3P20749 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCL3P20749 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCL3P20749 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BCL3P20749 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCL3P20749 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCL3P20749 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCL3P20749 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BCL3P20749 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCL3P20749 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCL3P20749 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCL3P20749 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCL3P20749 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCL3P20749 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCL3P20749 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCL3P20749 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCL3P20749 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCL3P20749 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCL3P20749 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCL3P20749 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCL3P20749 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCL3P20749 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCL3P20749 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCL3P20749 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCL3P20749 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BCL3P20749 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCL3P20749 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BCL3P20749 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCL3P20749 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCL3P20749 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCL3P20749 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCL3P20749 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCL3P20749 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCL3P20749 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCL3P20749 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCL3P20749 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCL3P20749 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCL3P20749 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCL3P20749 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCL3P20749 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCL3P20749 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCL3P20749 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCL3P20749 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCL3P20749 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCL3P20749 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCL3P20749 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCL3P20749 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCL3P20749 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCL3P20749 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCL3P20749 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BCL3P20749 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCL3P20749 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL3P20749 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL3P20749 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL3P20749 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL3P20749 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL3P20749 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL3P20749 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL3P20749 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL3P20749 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL3P20749 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL3P20749 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL3P20749 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL3P20749 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL3P20749 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL3P20749 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL3P20749 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL3P20749 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL3P20749 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL3P20749 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL3P20749 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL3P20749 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL3P20749 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL3P20749 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL3P20749 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL3P20749 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL3P20749 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL3P20749 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL3P20749 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL3P20749 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCL3P20749 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BCL3P20749 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCL3P20749 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCL3P20749 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCL3P20749 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCL3P20749 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCL3P20749 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCL3P20749 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCL3P20749 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCL3P20749 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCL3P20749 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCL3P20749 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCL3P20749 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCL3P20749 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCL3P20749 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCL3P20749 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms