Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR1P18146 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR1P18146 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR1P18146 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR1P18146 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGR1P18146 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGR1P18146 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR1P18146 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR1P18146 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR1P18146 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR1P18146 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR1P18146 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR1P18146 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR1P18146 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR1P18146 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR1P18146 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGR1P18146 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGR1P18146 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR1P18146 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR1P18146 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR1P18146 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR1P18146 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR1P18146 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR1P18146 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR1P18146 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EGR1P18146 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EGR1P18146 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EGR1P18146 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGR1P18146 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGR1P18146 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGR1P18146 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGR1P18146 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGR1P18146 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGR1P18146 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGR1P18146 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGR1P18146 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGR1P18146 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGR1P18146 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGR1P18146 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGR1P18146 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGR1P18146 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGR1P18146 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGR1P18146 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGR1P18146 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGR1P18146 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EGR1P18146 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EGR1P18146 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EGR1P18146 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EGR1P18146 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EGR1P18146 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EGR1P18146 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EGR1P18146 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EGR1P18146 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EGR1P18146 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EGR1P18146 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EGR1P18146 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EGR1P18146 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR1P18146 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR1P18146 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR1P18146 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR1P18146 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR1P18146 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR1P18146 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EGR1P18146 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EGR1P18146 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EGR1P18146 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EGR1P18146 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EGR1P18146 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EGR1P18146 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EGR1P18146 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EGR1P18146 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EGR1P18146 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR1P18146 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR1P18146 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR1P18146 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR1P18146 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR1P18146 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR1P18146 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR1P18146 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR1P18146 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR1P18146 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR1P18146 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR1P18146 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR1P18146 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR1P18146 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR1P18146 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR1P18146 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR1P18146 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR1P18146 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR1P18146 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR1P18146 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR1P18146 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR1P18146 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR1P18146 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR1P18146 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR1P18146 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR1P18146 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR1P18146 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR1P18146 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR1P18146 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms