Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PFKLP17858 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKLP17858 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKLP17858 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKLP17858 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKLP17858 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKLP17858 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKLP17858 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKLP17858 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKLP17858 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKLP17858 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFKLP17858 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFKLP17858 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFKLP17858 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFKLP17858 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKLP17858 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKLP17858 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKLP17858 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFKLP17858 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKLP17858 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKLP17858 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKLP17858 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKLP17858 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKLP17858 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKLP17858 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKLP17858 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKLP17858 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKLP17858 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKLP17858 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKLP17858 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKLP17858 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKLP17858 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKLP17858 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKLP17858 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKLP17858 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKLP17858 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKLP17858 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKLP17858 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PFKLP17858 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFKLP17858 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFKLP17858 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFKLP17858 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFKLP17858 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFKLP17858 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKLP17858 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKLP17858 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKLP17858 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKLP17858 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKLP17858 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKLP17858 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKLP17858 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKLP17858 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PFKLP17858 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PFKLP17858 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFKLP17858 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFKLP17858 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKLP17858 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKLP17858 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKLP17858 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKLP17858 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFKLP17858 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PFKLP17858 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PFKLP17858 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PFKLP17858 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKLP17858 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKLP17858 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFKLP17858 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKLP17858 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKLP17858 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PFKLP17858 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PFKLP17858 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PFKLP17858 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PFKLP17858 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PFKLP17858 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PFKLP17858 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PFKLP17858 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PFKLP17858 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PFKLP17858 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PFKLP17858 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PFKLP17858 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PFKLP17858 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PFKLP17858 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PFKLP17858 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PFKLP17858 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFKLP17858 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PFKLP17858 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms