Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL3L1P16619 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL3L1P16619 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL3L1P16619 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL3L1P16619 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL3L1P16619 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL3L1P16619 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL3L1P16619 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL3L1P16619 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL3L1P16619 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL3L1P16619 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL3L1P16619 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL3L1P16619 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL3L1P16619 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL3L1P16619 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL3L1P16619 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL3L1P16619 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL3L1P16619 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL3L1P16619 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL3L1P16619 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL3L1P16619 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL3L1P16619 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL3L1P16619 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL3L1P16619 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL3L1P16619 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL3L1P16619 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL3L1P16619 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL3L1P16619 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL3L1P16619 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL3L1P16619 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL3L1P16619 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL3L1P16619 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL3L1P16619 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL3L1P16619 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms