Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA1P14867 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRA1P14867 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRA1P14867 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA1P14867 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms