Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYF5P13349 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYF5P13349 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYF5P13349 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYF5P13349 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYF5P13349 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYF5P13349 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYF5P13349 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYF5P13349 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MYF5P13349 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYF5P13349 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYF5P13349 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYF5P13349 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYF5P13349 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYF5P13349 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYF5P13349 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYF5P13349 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYF5P13349 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYF5P13349 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYF5P13349 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYF5P13349 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYF5P13349 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYF5P13349 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYF5P13349 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYF5P13349 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYF5P13349 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYF5P13349 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYF5P13349 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYF5P13349 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYF5P13349 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYF5P13349 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYF5P13349 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYF5P13349 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYF5P13349 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYF5P13349 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYF5P13349 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYF5P13349 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYF5P13349 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYF5P13349 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYF5P13349 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYF5P13349 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYF5P13349 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYF5P13349 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYF5P13349 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYF5P13349 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYF5P13349 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYF5P13349 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYF5P13349 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYF5P13349 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYF5P13349 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYF5P13349 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYF5P13349 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYF5P13349 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYF5P13349 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYF5P13349 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYF5P13349 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYF5P13349 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYF5P13349 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYF5P13349 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYF5P13349 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYF5P13349 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYF5P13349 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYF5P13349 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYF5P13349 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYF5P13349 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYF5P13349 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYF5P13349 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYF5P13349 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYF5P13349 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYF5P13349 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MYF5P13349 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYF5P13349 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYF5P13349 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYF5P13349 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MYF5P13349 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYF5P13349 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYF5P13349 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYF5P13349 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYF5P13349 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYF5P13349 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYF5P13349 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYF5P13349 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYF5P13349 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYF5P13349 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYF5P13349 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYF5P13349 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYF5P13349 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYF5P13349 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYF5P13349 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYF5P13349 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYF5P13349 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYF5P13349 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYF5P13349 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYF5P13349 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYF5P13349 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYF5P13349 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MYF5P13349 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MYF5P13349 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYF5P13349 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYF5P13349 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms