Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEPDP12955 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEPDP12955 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEPDP12955 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEPDP12955 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEPDP12955 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEPDP12955 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PEPDP12955 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEPDP12955 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEPDP12955 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEPDP12955 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEPDP12955 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEPDP12955 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEPDP12955 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEPDP12955 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEPDP12955 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEPDP12955 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEPDP12955 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEPDP12955 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PEPDP12955 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEPDP12955 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEPDP12955 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEPDP12955 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEPDP12955 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEPDP12955 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEPDP12955 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEPDP12955 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEPDP12955 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEPDP12955 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEPDP12955 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEPDP12955 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEPDP12955 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEPDP12955 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEPDP12955 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEPDP12955 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEPDP12955 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEPDP12955 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEPDP12955 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEPDP12955 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEPDP12955 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PEPDP12955 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEPDP12955 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEPDP12955 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEPDP12955 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEPDP12955 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PEPDP12955 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEPDP12955 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PEPDP12955 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEPDP12955 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEPDP12955 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEPDP12955 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEPDP12955 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEPDP12955 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEPDP12955 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PEPDP12955 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEPDP12955 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEPDP12955 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEPDP12955 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEPDP12955 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEPDP12955 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEPDP12955 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEPDP12955 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEPDP12955 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEPDP12955 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEPDP12955 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEPDP12955 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEPDP12955 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEPDP12955 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEPDP12955 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEPDP12955 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEPDP12955 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEPDP12955 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEPDP12955 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEPDP12955 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEPDP12955 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PEPDP12955 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEPDP12955 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEPDP12955 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEPDP12955 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEPDP12955 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEPDP12955 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEPDP12955 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEPDP12955 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEPDP12955 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PEPDP12955 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEPDP12955 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEPDP12955 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEPDP12955 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEPDP12955 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEPDP12955 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEPDP12955 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEPDP12955 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEPDP12955 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEPDP12955 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEPDP12955 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEPDP12955 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEPDP12955 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEPDP12955 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEPDP12955 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEPDP12955 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms