Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPB2P08579 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPB2P08579 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPB2P08579 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms