Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC1P07992 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC1P07992 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC1P07992 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms