Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HLA-DRAP01903 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HLA-DRAP01903 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HLA-DRAP01903 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DRAP01903 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DRAP01903 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DRAP01903 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DRAP01903 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DRAP01903 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DRAP01903 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DRAP01903 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DRAP01903 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HLA-DRAP01903 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HLA-DRAP01903 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HLA-DRAP01903 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DRAP01903 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HLA-DRAP01903 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HLA-DRAP01903 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DRAP01903 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DRAP01903 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DRAP01903 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DRAP01903 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLA-DRAP01903 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLA-DRAP01903 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HLA-DRAP01903 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DRAP01903 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms