Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDT3O95989 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDT3O95989 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDT3O95989 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDT3O95989 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDT3O95989 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDT3O95989 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDT3O95989 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDT3O95989 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUDT3O95989 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms