Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT4O95628 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT4O95628 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT4O95628 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms