Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CSPG5O95196 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSPG5O95196 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSPG5O95196 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSPG5O95196 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSPG5O95196 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSPG5O95196 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSPG5O95196 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSPG5O95196 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSPG5O95196 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSPG5O95196 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSPG5O95196 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSPG5O95196 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSPG5O95196 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSPG5O95196 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms