Protein–RNA interactions for Protein: O94911

ABCA8, ATP-binding cassette sub-family A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA8O94911 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
ABCA8O94911 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
ABCA8O94911 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
ABCA8O94911 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCA8O94911 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCA8O94911 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCA8O94911 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCA8O94911 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCA8O94911 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ABCA8O94911 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
ABCA8O94911 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCA8O94911 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCA8O94911 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCA8O94911 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCA8O94911 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCA8O94911 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCA8O94911 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCA8O94911 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCA8O94911 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ABCA8O94911 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ABCA8O94911 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCA8O94911 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.22
ABCA8O94911 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
ABCA8O94911 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCA8O94911 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCA8O94911 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCA8O94911 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ABCA8O94911 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCA8O94911 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ABCA8O94911 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ABCA8O94911 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ABCA8O94911 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ABCA8O94911 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ABCA8O94911 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
ABCA8O94911 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ABCA8O94911 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCA8O94911 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ABCA8O94911 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms