Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DKK1O94907 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DKK1O94907 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DKK1O94907 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DKK1O94907 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DKK1O94907 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DKK1O94907 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DKK1O94907 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK1O94907 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK1O94907 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK1O94907 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DKK1O94907 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DKK1O94907 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DKK1O94907 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DKK1O94907 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DKK1O94907 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DKK1O94907 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DKK1O94907 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DKK1O94907 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK1O94907 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK1O94907 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK1O94907 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK1O94907 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DKK1O94907 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DKK1O94907 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DKK1O94907 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DKK1O94907 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DKK1O94907 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DKK1O94907 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DKK1O94907 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DKK1O94907 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DKK1O94907 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DKK1O94907 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DKK1O94907 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DKK1O94907 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DKK1O94907 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DKK1O94907 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DKK1O94907 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DKK1O94907 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DKK1O94907 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DKK1O94907 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DKK1O94907 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK1O94907 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK1O94907 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK1O94907 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK1O94907 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK1O94907 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DKK1O94907 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DKK1O94907 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DKK1O94907 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DKK1O94907 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DKK1O94907 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DKK1O94907 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DKK1O94907 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DKK1O94907 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DKK1O94907 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DKK1O94907 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DKK1O94907 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DKK1O94907 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DKK1O94907 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DKK1O94907 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK1O94907 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK1O94907 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK1O94907 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK1O94907 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK1O94907 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK1O94907 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DKK1O94907 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DKK1O94907 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DKK1O94907 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DKK1O94907 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DKK1O94907 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DKK1O94907 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DKK1O94907 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK1O94907 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK1O94907 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK1O94907 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DKK1O94907 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DKK1O94907 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DKK1O94907 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DKK1O94907 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DKK1O94907 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK1O94907 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK1O94907 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK1O94907 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK1O94907 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK1O94907 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK1O94907 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DKK1O94907 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DKK1O94907 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DKK1O94907 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DKK1O94907 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DKK1O94907 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DKK1O94907 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DKK1O94907 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DKK1O94907 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DKK1O94907 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DKK1O94907 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK1O94907 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK1O94907 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms