Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ECM2O94769 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ECM2O94769 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ECM2O94769 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ECM2O94769 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ECM2O94769 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ECM2O94769 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ECM2O94769 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ECM2O94769 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ECM2O94769 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ECM2O94769 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ECM2O94769 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ECM2O94769 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ECM2O94769 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ECM2O94769 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ECM2O94769 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ECM2O94769 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ECM2O94769 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ECM2O94769 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ECM2O94769 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ECM2O94769 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ECM2O94769 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ECM2O94769 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ECM2O94769 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ECM2O94769 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ECM2O94769 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ECM2O94769 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ECM2O94769 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ECM2O94769 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ECM2O94769 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ECM2O94769 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ECM2O94769 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ECM2O94769 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ECM2O94769 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ECM2O94769 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ECM2O94769 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ECM2O94769 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ECM2O94769 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ECM2O94769 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ECM2O94769 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ECM2O94769 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ECM2O94769 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ECM2O94769 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ECM2O94769 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ECM2O94769 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ECM2O94769 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ECM2O94769 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ECM2O94769 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ECM2O94769 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ECM2O94769 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ECM2O94769 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ECM2O94769 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ECM2O94769 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ECM2O94769 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ECM2O94769 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ECM2O94769 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ECM2O94769 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ECM2O94769 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ECM2O94769 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ECM2O94769 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ECM2O94769 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ECM2O94769 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ECM2O94769 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ECM2O94769 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ECM2O94769 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ECM2O94769 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ECM2O94769 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ECM2O94769 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ECM2O94769 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ECM2O94769 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ECM2O94769 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ECM2O94769 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ECM2O94769 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ECM2O94769 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ECM2O94769 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM2O94769 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM2O94769 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM2O94769 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM2O94769 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM2O94769 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM2O94769 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM2O94769 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM2O94769 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM2O94769 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ECM2O94769 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM2O94769 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM2O94769 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM2O94769 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ECM2O94769 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ECM2O94769 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ECM2O94769 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ECM2O94769 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ECM2O94769 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ECM2O94769 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ECM2O94769 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ECM2O94769 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ECM2O94769 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ECM2O94769 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ECM2O94769 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ECM2O94769 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms