Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA10O75578 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA10O75578 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGA10O75578 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA10O75578 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA10O75578 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms