Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GFRA3O60609 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GFRA3O60609 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFRA3O60609 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFRA3O60609 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GFRA3O60609 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms