Protein–RNA interactions for Protein: O60315

ZEB2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB2O60315 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZEB2O60315 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZEB2O60315 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ZEB2O60315 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZEB2O60315 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZEB2O60315 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms