Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP9BO43861 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP9BO43861 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP9BO43861 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP9BO43861 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP9BO43861 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms