Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUV39H1O43463 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUV39H1O43463 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUV39H1O43463 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.3 ms