Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRID2O43424 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRID2O43424 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRID2O43424 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GRID2O43424 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRID2O43424 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRID2O43424 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRID2O43424 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRID2O43424 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRID2O43424 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRID2O43424 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRID2O43424 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRID2O43424 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRID2O43424 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRID2O43424 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRID2O43424 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRID2O43424 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRID2O43424 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRID2O43424 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRID2O43424 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRID2O43424 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRID2O43424 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRID2O43424 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRID2O43424 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRID2O43424 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRID2O43424 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRID2O43424 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRID2O43424 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRID2O43424 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GRID2O43424 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRID2O43424 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRID2O43424 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRID2O43424 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRID2O43424 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRID2O43424 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRID2O43424 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRID2O43424 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRID2O43424 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRID2O43424 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRID2O43424 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRID2O43424 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRID2O43424 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRID2O43424 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRID2O43424 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRID2O43424 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRID2O43424 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRID2O43424 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRID2O43424 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRID2O43424 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRID2O43424 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRID2O43424 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRID2O43424 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRID2O43424 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GRID2O43424 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRID2O43424 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRID2O43424 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRID2O43424 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRID2O43424 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRID2O43424 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRID2O43424 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRID2O43424 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRID2O43424 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRID2O43424 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRID2O43424 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRID2O43424 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRID2O43424 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRID2O43424 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRID2O43424 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRID2O43424 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRID2O43424 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRID2O43424 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRID2O43424 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRID2O43424 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRID2O43424 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRID2O43424 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRID2O43424 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRID2O43424 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRID2O43424 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRID2O43424 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRID2O43424 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRID2O43424 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRID2O43424 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRID2O43424 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRID2O43424 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRID2O43424 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRID2O43424 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GRID2O43424 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRID2O43424 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRID2O43424 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRID2O43424 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRID2O43424 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRID2O43424 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRID2O43424 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRID2O43424 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRID2O43424 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRID2O43424 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRID2O43424 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRID2O43424 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRID2O43424 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRID2O43424 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms