Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSMD3O43242 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD3O43242 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD3O43242 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms