Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SYNJ2O15056 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SYNJ2O15056 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SYNJ2O15056 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
SYNJ2O15056 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.55
SYNJ2O15056 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.44■■■■■ 4.54
SYNJ2O15056 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SYNJ2O15056 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
SYNJ2O15056 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
SYNJ2O15056 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
SYNJ2O15056 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
SYNJ2O15056 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SYNJ2O15056 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
SYNJ2O15056 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
SYNJ2O15056 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
SYNJ2O15056 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
SYNJ2O15056 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SYNJ2O15056 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SYNJ2O15056 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SYNJ2O15056 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
SYNJ2O15056 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SYNJ2O15056 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SYNJ2O15056 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SYNJ2O15056 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SYNJ2O15056 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
SYNJ2O15056 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.32■■■■■ 4.52
SYNJ2O15056 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
SYNJ2O15056 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
SYNJ2O15056 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SYNJ2O15056 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
SYNJ2O15056 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
SYNJ2O15056 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
SYNJ2O15056 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SYNJ2O15056 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SYNJ2O15056 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SYNJ2O15056 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SYNJ2O15056 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
SYNJ2O15056 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
SYNJ2O15056 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SYNJ2O15056 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SYNJ2O15056 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SYNJ2O15056 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
SYNJ2O15056 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SYNJ2O15056 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SYNJ2O15056 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
SYNJ2O15056 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SYNJ2O15056 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SYNJ2O15056 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SYNJ2O15056 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
SYNJ2O15056 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SYNJ2O15056 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
SYNJ2O15056 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
SYNJ2O15056 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
SYNJ2O15056 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SYNJ2O15056 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SYNJ2O15056 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SYNJ2O15056 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SYNJ2O15056 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SYNJ2O15056 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SYNJ2O15056 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
SYNJ2O15056 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1420.1 ms