Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
KDM6BO15054 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
KDM6BO15054 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
KDM6BO15054 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
KDM6BO15054 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
KDM6BO15054 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
KDM6BO15054 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
KDM6BO15054 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
KDM6BO15054 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
KDM6BO15054 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
KDM6BO15054 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
KDM6BO15054 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
KDM6BO15054 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
KDM6BO15054 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
KDM6BO15054 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
KDM6BO15054 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
KDM6BO15054 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
KDM6BO15054 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
KDM6BO15054 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
KDM6BO15054 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
KDM6BO15054 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
KDM6BO15054 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
KDM6BO15054 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
KDM6BO15054 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
KDM6BO15054 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
KDM6BO15054 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
KDM6BO15054 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
KDM6BO15054 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
KDM6BO15054 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
KDM6BO15054 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
KDM6BO15054 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
KDM6BO15054 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
KDM6BO15054 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
KDM6BO15054 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
KDM6BO15054 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
KDM6BO15054 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
KDM6BO15054 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
KDM6BO15054 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
KDM6BO15054 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
KDM6BO15054 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
KDM6BO15054 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
KDM6BO15054 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
KDM6BO15054 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
KDM6BO15054 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
KDM6BO15054 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
KDM6BO15054 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
KDM6BO15054 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
KDM6BO15054 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
KDM6BO15054 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
KDM6BO15054 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
KDM6BO15054 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
KDM6BO15054 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
KDM6BO15054 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
KDM6BO15054 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
KDM6BO15054 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
KDM6BO15054 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
KDM6BO15054 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
KDM6BO15054 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
KDM6BO15054 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
KDM6BO15054 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
KDM6BO15054 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.6■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
KDM6BO15054 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
KDM6BO15054 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
KDM6BO15054 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
KDM6BO15054 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
KDM6BO15054 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
KDM6BO15054 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM6BO15054 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM6BO15054 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM6BO15054 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM6BO15054 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms