Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TM4SF5O14894 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF5O14894 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF5O14894 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF5O14894 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF5O14894 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF5O14894 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF5O14894 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF5O14894 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF5O14894 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF5O14894 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF5O14894 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF5O14894 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF5O14894 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF5O14894 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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