Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC9O14530 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TXNDC9O14530 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TXNDC9O14530 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TXNDC9O14530 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms