Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA4O00629 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA4O00629 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KPNA4O00629 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms