Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
MEIS1O00470 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEIS1O00470 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MEIS1O00470 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS1O00470 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS1O00470 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS1O00470 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS1O00470 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS1O00470 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MEIS1O00470 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS1O00470 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS1O00470 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS1O00470 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms