Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD12O00232 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD12O00232 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD12O00232 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD12O00232 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms