Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF10AO00220 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF10AO00220 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF10AO00220 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF10AO00220 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFRSF10AO00220 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF10AO00220 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms