Protein–RNA interactions for Protein: J3QT63

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QT63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QT63 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QT63 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QT63 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QT63 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QT63 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QT63 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QT63 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
J3QT63 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
J3QT63 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22■■□□□ 1.11
J3QT63 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
J3QT63 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
J3QT63 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
J3QT63 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QT63 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
J3QT63 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QT63 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QT63 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QT63 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QT63 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QT63 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QT63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QT63 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QT63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QT63 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QT63 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QT63 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QT63 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QT63 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QT63 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QT63 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QT63 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QT63 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QT63 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QT63 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QT63 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QT63 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QT63 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QT63 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QT63 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QT63 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QT63 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QT63 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QT63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QT63 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QT63 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QT63 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QT63 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QT63 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3QT63 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3QT63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QT63 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QT63 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QT63 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QT63 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QT63 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QT63 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QT63 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QT63 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QT63 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QT63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QT63 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QT63 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QT63 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QT63 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QT63 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QT63 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QT63 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QT63 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QT63 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QT63 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QT63 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
J3QT63 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
J3QT63 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QT63 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QT63 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QT63 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QT63 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QT63 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QT63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QT63 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QT63 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QT63 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QT63 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QT63 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QT63 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QT63 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QT63 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QT63 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QT63 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QT63 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QT63 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QT63 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QT63 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QT63 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QT63 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QT63 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QT63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QT63 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QT63 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms