Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC01387J3KSC0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC01387J3KSC0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC01387J3KSC0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01387J3KSC0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01387J3KSC0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01387J3KSC0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01387J3KSC0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01387J3KSC0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01387J3KSC0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01387J3KSC0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC01387J3KSC0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01387J3KSC0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms