Protein–RNA interactions for Protein: G5E9Z4

PI4K2B, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2BG5E9Z4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PI4K2BG5E9Z4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PI4K2BG5E9Z4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PI4K2BG5E9Z4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4K2BG5E9Z4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4K2BG5E9Z4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4K2BG5E9Z4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PI4K2BG5E9Z4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4K2BG5E9Z4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4K2BG5E9Z4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4K2BG5E9Z4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4K2BG5E9Z4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PI4K2BG5E9Z4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PI4K2BG5E9Z4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PI4K2BG5E9Z4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4K2BG5E9Z4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4K2BG5E9Z4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms