Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf98E9PRG8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf98E9PRG8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf98E9PRG8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf98E9PRG8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf98E9PRG8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf98E9PRG8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf98E9PRG8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf98E9PRG8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf98E9PRG8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf98E9PRG8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C11orf98E9PRG8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms