Protein–RNA interactions for Protein: E5RHQ5

NPIPB11, Nuclear pore complex-interacting protein family member B11, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11E5RHQ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB11E5RHQ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB11E5RHQ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPIPB11E5RHQ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB11E5RHQ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms