Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACD1B0YJ81 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HACD1B0YJ81 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HACD1B0YJ81 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HACD1B0YJ81 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACD1B0YJ81 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACD1B0YJ81 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACD1B0YJ81 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HACD1B0YJ81 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HACD1B0YJ81 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HACD1B0YJ81 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HACD1B0YJ81 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HACD1B0YJ81 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HACD1B0YJ81 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms