Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPK3BL1B0FP48 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPK3BL1B0FP48 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UPK3BL1B0FP48 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UPK3BL1B0FP48 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UPK3BL1B0FP48 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UPK3BL1B0FP48 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPK3BL1B0FP48 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPK3BL1B0FP48 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPK3BL1B0FP48 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms