Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A8MVJ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A8MVJ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A8MVJ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A8MVJ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A8MVJ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A8MVJ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A8MVJ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A8MVJ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A8MVJ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A8MVJ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A8MVJ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A8MVJ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A8MVJ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A8MVJ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
A8MVJ9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A8MVJ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
A8MVJ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A8MVJ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A8MVJ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
A8MVJ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A8MVJ9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A8MVJ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A8MVJ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A8MVJ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A8MVJ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A8MVJ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A8MVJ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A8MVJ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A8MVJ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A8MVJ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A8MVJ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A8MVJ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A8MVJ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A8MVJ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A8MVJ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A8MVJ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A8MVJ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A8MVJ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A8MVJ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A8MVJ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A8MVJ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A8MVJ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A8MVJ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A8MVJ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A8MVJ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A8MVJ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A8MVJ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A8MVJ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A8MVJ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
A8MVJ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
A8MVJ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A8MVJ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A8MVJ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A8MVJ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
A8MVJ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A8MVJ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A8MVJ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A8MVJ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A8MVJ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A8MVJ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A8MVJ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A8MVJ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A8MVJ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A8MVJ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A8MVJ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A8MVJ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A8MVJ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A8MVJ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A8MVJ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A8MVJ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A8MVJ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A8MVJ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A8MVJ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A8MVJ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A8MVJ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A8MVJ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A8MVJ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A8MVJ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A8MVJ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A8MVJ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A8MVJ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A8MVJ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A8MVJ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A8MVJ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A8MVJ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A8MVJ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A8MVJ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A8MVJ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A8MVJ9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A8MVJ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A8MVJ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A8MVJ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A8MVJ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A8MVJ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A8MVJ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A8MVJ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A8MVJ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A8MVJ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A8MVJ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms