Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGLL3A8MV65 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VGLL3A8MV65 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGLL3A8MV65 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGLL3A8MV65 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms